玛纳斯县按照“工业进园区、招商进规划”的总体要求，密切结合本地实际，以园引企、以企兴园,科学规划，合理布局，重点加强了五大工业园区建设。一是加强城西工业园区建设。重点发展电力、浆粕、短丝、化工、棉纺等行业，培育全疆最大的电力生产基地、全国最大的棉浆粕和粘胶短丝生产基地。目前已形成以天山电力、澳洋科技、金信化工、恒诚棉纺为龙头的产业集群;二是加强城南工业园区建设。以农夫山泉、屯河番茄为龙头，抓好产品延伸配套和规模扩张，在全疆形成特色鲜明的食品工业园;三是加强城东工业区建设。重点以石油化工、煤化工、轧花、纺织等为主，积极建设综合工业园;四是加强城北工业园区建设。重点以农副产品加工、水产、畜牧、生物制药为主，建设高科技工业园;五是加强南山能源工业园区建设。以发展煤电一体化、水电一体化、矿产资源开发和下游产品延伸等为主，建设能源矿产工业园。截至目前，玛纳斯县已累计投入近2亿元，用于工业园区的基础设施建设和配套设施完善，五大工业园区的雏形已基本形成。2006年，该县五大工业园区累计引进项目7个，其中：亿元以上项目1个，5000万元以上的项目2个，园区工业增加值45000万元，园区工业总产值122000万元。